Les travaux de recherche du Dr Cunliffe se concentrent sur les types de dommages subis par les sites archéologiques au Moyen-Orient en temps de paix et de guerre, et sur le développement de moyens d’identification et d’enregistrement des menaces en utilisant l’imagerie satellite et les médias sociaux, afin d’aider à développer des moyens pour mieux protéger les sites.
Ces travaux se sont principalement concentrés sur la Syrie et l’Irak. Dans ce cadre, elle s’intéresse aux relations civilo-militaires avant, pendant et après les conflits, et à la manière dont le patrimoine peut être utilisé dans la consolidation de la paix et dans les scénarios d’après-conflit.
Le Dr Cunliffe est également membre du Comité britannique du Blue Shield, un organisme de bienfaisance qui œuvre pour protéger les sites archéologiques des conflits et des catastrophes naturelles, et est bénévole pour l’ONG « Patrimoine pour la Paix ».